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La coordinación sanitaria nació como una necesidad en las conclusiones de las Primeras Jornadas de Cooperación Sanitaria con el Pueblo Saharaui, celebradas en Vitoria-Gasteiz en 1991. En las Segundas Jornadas, que tuvieron lugar en Vitoria-Gasteiz en 1996, se insistió en la necesidad de la coordinación y se concluyó en la creación de una Oficina de Coordinación Sanitaria Saharaui (OCSS) estable, como un instrumento de comunicación e información y en que se requería una oficina física con trabajo profesionalizado de administración. Finalmente, en las Terceras Jornadas (Vitoria-Gasteiz, 2003) se solicitó la creación de una página web para facilitar la coordinación y el acceso a la información sanitaria.
Ubicada físicamente en Vitoria-Gasteiz, la OCSS es una dependencia del Ministerio de Salud de la RASD (República Árabe Saharaui Democrática). Como tal dependencia del Ministerio, la toma de decisiones pertenece al mismo, y la oficina es un elemento de coordinación, consulta e información.
La OCSS recopila y edita información sobre la salud en los campos de refugiados, coordina los viajes de las comisiones médicas y quirúrgicas que se desplazan a los campamentos y da respuesta a las solicitudes de información que tienen relación con la salud en los campos.